MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022607	TGT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022607	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022607	TTCC	2	8	228	235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022607	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022607	TAA	2	6	406	411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022607	AAT	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022607	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022607	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022607	T	7	7	579	585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022607	TCAT	2	8	620	627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022607	TA	3	6	633	638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022607	TA	3	6	644	649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022607	A	6	6	669	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022607	A	6	6	696	701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022607	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022607	GAAC	2	8	771	778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022607	AC	3	6	777	782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022607	CAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650831
20	NC_022607	GTAA	2	8	852	859	50 %	25 %	25 %	0 %	554650831
21	NC_022607	AAT	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650831
22	NC_022607	TATTT	2	10	896	905	20 %	80 %	0 %	0 %	554650831
23	NC_022607	AGAA	2	8	913	920	75 %	0 %	25 %	0 %	554650831
24	NC_022607	GAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650831
25	NC_022607	AGAACA	2	12	1103	1114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554650831
26	NC_022607	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022607	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
28	NC_022607	A	10	10	1190	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
29	NC_022607	T	6	6	1210	1215	0 %	100 %	0 %	0 %	554650832
30	NC_022607	T	6	6	1227	1232	0 %	100 %	0 %	0 %	554650832
31	NC_022607	GT	3	6	1269	1274	0 %	50 %	50 %	0 %	554650832
32	NC_022607	AAT	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
33	NC_022607	TTCCAT	2	12	1309	1320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554650832
34	NC_022607	TC	3	6	1442	1447	0 %	50 %	0 %	50 %	554650832
35	NC_022607	CAT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650832
36	NC_022607	GCA	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650832
37	NC_022607	GGAT	2	8	1625	1632	25 %	25 %	50 %	0 %	554650832
38	NC_022607	TAA	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
39	NC_022607	CT	3	6	1839	1844	0 %	50 %	0 %	50 %	554650832
40	NC_022607	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
41	NC_022607	CAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650832
42	NC_022607	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
43	NC_022607	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
44	NC_022607	A	6	6	1978	1983	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
45	NC_022607	A	7	7	2090	2096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022607	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022607	T	6	6	2155	2160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022607	TC	3	6	2190	2195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022607	T	6	6	2229	2234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022607	GTT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022607	TCT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022607	ATT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
53	NC_022607	CTA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
54	NC_022607	TA	3	6	2376	2381	50 %	50 %	0 %	0 %	554650833
55	NC_022607	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
56	NC_022607	TTC	2	6	2428	2433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
57	NC_022607	TAATCA	2	12	2480	2491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554650833
58	NC_022607	ATC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
59	NC_022607	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
60	NC_022607	CTT	2	6	2616	2621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
61	NC_022607	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
62	NC_022607	TTC	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
63	NC_022607	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
64	NC_022607	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
65	NC_022607	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
66	NC_022607	CCATT	2	10	2912	2921	20 %	40 %	0 %	40 %	554650833
67	NC_022607	TA	3	6	3015	3020	50 %	50 %	0 %	0 %	554650833
68	NC_022607	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
69	NC_022607	TTC	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
70	NC_022607	ATC	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
71	NC_022607	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
72	NC_022607	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
73	NC_022607	TCA	3	9	3296	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
74	NC_022607	AAG	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
75	NC_022607	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
76	NC_022607	CTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
77	NC_022607	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
78	NC_022607	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
79	NC_022607	TTG	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
80	NC_022607	TAA	2	6	3704	3709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
81	NC_022607	TCA	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
82	NC_022607	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
83	NC_022607	AAG	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
84	NC_022607	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
85	NC_022607	GATT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	25 %	0 %	554650833
86	NC_022607	AAAAT	2	10	3927	3936	80 %	20 %	0 %	0 %	554650833
87	NC_022607	AGT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
88	NC_022607	TGC	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650833
89	NC_022607	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
90	NC_022607	GTA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
91	NC_022607	ACA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650833
92	NC_022607	T	6	6	4232	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	554650833
93	NC_022607	GTAAA	2	10	4244	4253	60 %	20 %	20 %	0 %	554650833
94	NC_022607	GATTG	2	10	4285	4294	20 %	40 %	40 %	0 %	554650833
95	NC_022607	ATAA	2	8	4295	4302	75 %	25 %	0 %	0 %	554650833
96	NC_022607	GAA	2	6	4315	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
97	NC_022607	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	554650833
98	NC_022607	CCT	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022607	TATT	2	8	4530	4537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022607	TGC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022607	GTG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022607	A	7	7	4787	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022607	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022607	TAA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022607	AATT	2	8	4918	4925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022607	TAT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022607	TTG	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022607	ATT	2	6	4976	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022607	T	7	7	4996	5002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022607	ATC	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650841
111	NC_022607	CTT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650841
112	NC_022607	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650841
113	NC_022607	GCA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650841
114	NC_022607	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650841
115	NC_022607	GTA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650841
116	NC_022607	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650842
117	NC_022607	TAA	2	6	5442	5447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022607	CTTCTG	2	12	5480	5491	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022607	GTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022607	A	7	7	5542	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022607	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
122	NC_022607	AGC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
123	NC_022607	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
124	NC_022607	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
125	NC_022607	TCCA	2	8	5681	5688	25 %	25 %	0 %	50 %	554650843
126	NC_022607	A	6	6	5801	5806	100 %	0 %	0 %	0 %	554650843
127	NC_022607	TCAA	2	8	5808	5815	50 %	25 %	0 %	25 %	554650843
128	NC_022607	CTC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022607	TAT	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022607	TTAC	2	8	5894	5901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022607	T	7	7	5970	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022607	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022607	TAG	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022607	ACG	2	6	6205	6210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022607	ATCCC	2	10	6359	6368	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_022607	T	7	7	6389	6395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022607	TTC	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022607	TGAA	2	8	6474	6481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022607	AAT	2	6	6509	6514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022607	AAAT	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022607	TTG	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022607	ATT	2	6	6652	6657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022607	A	6	6	6694	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	554650834
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278	NC_022607	A	6	6	12415	12420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_022607	TAT	2	6	12421	12426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_022607	T	7	7	12432	12438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_022607	TTG	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_022607	TAT	2	6	12460	12465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022607	TAAAA	2	10	12484	12493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_022607	TTGA	2	8	12502	12509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022607	AT	3	6	12533	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_022607	AAT	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_022607	TAG	2	6	12614	12619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022607	ATT	2	6	12620	12625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022607	ATC	2	6	12626	12631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_022607	ACCTA	2	10	12691	12700	40 %	20 %	0 %	40 %	554650838
291	NC_022607	TAA	2	6	12706	12711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
292	NC_022607	T	6	6	12714	12719	0 %	100 %	0 %	0 %	554650838
293	NC_022607	ATT	3	9	12722	12730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650838
294	NC_022607	ATA	2	6	12813	12818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
295	NC_022607	AGT	2	6	12868	12873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650838
296	NC_022607	TAA	2	6	12885	12890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
297	NC_022607	CTA	2	6	12904	12909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650838
298	NC_022607	CTT	2	6	12933	12938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650838
299	NC_022607	TAAA	2	8	12992	12999	75 %	25 %	0 %	0 %	554650838
300	NC_022607	TTA	2	6	13146	13151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650838
301	NC_022607	GTT	3	9	13299	13307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650838
302	NC_022607	AATA	2	8	13371	13378	75 %	25 %	0 %	0 %	554650838
303	NC_022607	TA	3	6	13377	13382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_022607	TAA	2	6	13438	13443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650839
305	NC_022607	T	6	6	13491	13496	0 %	100 %	0 %	0 %	554650839
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308	NC_022607	AAT	2	6	13683	13688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650839
309	NC_022607	GCT	2	6	13735	13740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650839
310	NC_022607	T	6	6	13767	13772	0 %	100 %	0 %	0 %	554650839
311	NC_022607	T	6	6	13810	13815	0 %	100 %	0 %	0 %	554650839
312	NC_022607	A	6	6	13916	13921	100 %	0 %	0 %	0 %	554650839
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315	NC_022607	TCAT	2	8	14007	14014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
316	NC_022607	A	7	7	14048	14054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_022607	TATT	2	8	14105	14112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_022607	TAA	2	6	14120	14125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_022607	CTTC	2	8	14157	14164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
320	NC_022607	TAA	2	6	14201	14206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_022607	A	6	6	14242	14247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_022607	TCTT	2	8	14450	14457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
323	NC_022607	CTT	2	6	14591	14596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_022607	AAG	2	6	14752	14757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_022607	TGATT	2	10	14886	14895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
326	NC_022607	AAT	2	6	14921	14926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_022607	ATA	2	6	14954	14959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_022607	GCT	3	9	15114	15122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
329	NC_022607	GTCAA	2	10	15183	15192	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
330	NC_022607	ACA	2	6	15193	15198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
331	NC_022607	ATA	2	6	15270	15275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_022607	TTTG	2	8	15285	15292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
333	NC_022607	TCTTT	2	10	15421	15430	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
334	NC_022607	AGA	2	6	15452	15457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.